При очередном обновлении обзора. Кристалл оказался в минусе, который потихоньку уменьшался по мере выработки ресурса. В постройках также отражалось, что необходимо больше кристалла, чем нужно для здания. Ник Buka Квазар
Я точно не уверен, но возможно совпало вместе начало строительства постройки (стояла в очереди), и начала исследования (нажимал вручную). Но точно не уверен.